1、原則上，參合農民每人每年補償標準最高不超過6000元。參合農民因患大病，當年醫療費數額特大的實行二次補償。二次補償最高限額不超過6000元。即參合農民當年因患大病住院治療，當年可享受最高12000元的補償。少數縣市制定的方案略高于此標準。

2、新農合范圍內的住院費用和報銷比例也由60%提高到了70%，最高的支付限額已經從3萬元提高到不低于5萬元。同時各地還將普遍開展新農合的門診統籌，農民門診就醫也可以按照比例來報銷。這個報銷比例是根據醫院等級來的，而不是按照市級或者縣級來的，另外各個省根據當地經濟水平不同，報銷比例也會有5%的差異：

門診報銷比例上調至30%，住院報銷比例一級醫院不低于75%、二級醫院不低于55%、三級醫院不低于45%，范圍內住院實際補償比達到70%，最高封頂線10萬元，達到農民年人均純收入10倍以上。基本藥物、中藥飲片（包括院內中藥制劑）及中醫針灸、推拿、拔罐、刮痧等中醫適宜技術報銷比例提高10%。

3、衛生部會啟動農村居民重大疾病醫療工作，由農村兒童先心病和急性白血病開始，逐步擴大到20種疾病。新農合在限定費用基礎上，將重大疾病的報銷比例提高到70%，對于符合條件的救助對象醫療救助再補償20%。