農村商業銀行由農村信用社改制而來，二者具有一定的歷史淵源，同為農村金融服務主力軍，但也有很大的區別。

農村信用社又稱為農商行的祖師爺。最早的農村信用社始于1951年，那個時候根本沒有農商行，是人民銀行把設置在農村的網點，交給地方管理，改為農村信用社。當時辦行的宗旨是“農民在資金上互相幫助”，所以由社員出錢構成資本金，社員用錢時可以貸款，這種模式維持了很長一段時間。2004年信用社進行了一次產權制度改革，央行和地方政府拿出1650億為地方信用社的虧空買單，將原來由社員出資構成的資本，轉換成國有產權。

2003年農村信用社再次迎來重大改革，國家下發“深化農村信用社改革試點方案”，要求按照市場經濟規則，進一步明晰產權關系，促進信用社法人治理結構完善，經營機制轉換，使信用社真正成為自主經營，自我約束，自我發展，自擔風險的市場主體，其中重要內容之一就是信用社改制組建農村商業銀行。

當時對信用社組建農村商業銀行提出幾個要求:一是有較強的管理能力；二是全轄資產總規模不低于10億；三是不良貸款率在15%以下；四是組建后資本金不低于5600萬，資本充足率不低于8%。符合以上條件的農村信用社均可以申請組建農村商業銀行。

截止2019年底，農村商業銀行從無到有發展到1423家，農村信用社則不斷減員萎縮至782家，他們的區別也日漸明顯:

1.產權性質不同。信用社產權屬于地方國有，性質單一，而農商銀行產權結構中不僅允許國有，還有企業或自然人參股，結構多元化，持股比例最大者為控股股東。

2.組織架構不同。信用社一般以縣級聯社為獨立法人組織，負責各社經營和統一核算，但在行政管理上一般由省級聯社負責；農村商業銀行則直接以總行身份成為一個獨立法人組織，下轄各分支行，并負責業務經營和行政管理，其他任何單位無權干涉。

3.資產規模和區域輻射范圍不同。因為農村信用社一般以縣級聯社為獨立法人，所以業務范圍僅限于縣級范圍之內；而農村商業銀行一般由多個縣級聯社合并而成，所以它的業務區域覆蓋范圍更寬，資產規模更大。

4.服務功能不同。因為農村信用社資產規模較小，管理能力有限，因此在監管條件下它的服務功能就比較單一，比如大多數都以存款貸款和結算支付為主；而農村商業銀行隨著資產規模和業務管理水平達到一定程度，就可以申請更多業務牌照，比如理財產品、基金、大額存單以、債券及其他衍生品等業務。

由此可見，在我們選擇農村信用社和農村商業銀行時，如果僅限于傳統存貸業務，二者幾乎沒有什么區別；但如果是涉及異地結算業務，還是農村商業銀行更好，畢竟輻射范圍寬一點，可以避免手續費；同時，如果想購買理財類產品，農村商業銀行選擇空間更大一些。