福建海峽銀行的前身是福州市商業銀行，成立于1996年12月27日，是經福州市政府同意，由中國人民銀行總行批準，在福州市原14家城市信用社和城市信用社聯社的基礎上，由地方財政、企業法人和個人共同參股組建，具有獨立法人資格的福州市第一家地方性股份制商業銀行，2009年12月7日上午正式更名為福建海峽銀行。目前，福建海峽銀行擁有員工總人數5500余人，下轄1家營業部，漳州、龍巖、寧德、泉州、溫州、莆田6家分行和41家支行，實行“總行—分行（直屬行）---支行”扁平式經營管理模式。

2007年實現跨區域經營，由地方性銀行轉變為區域性銀行、全國性銀行，共設有48個營業網點，網點機構從福州向全省乃至省外輻射，在漳州、龍巖、寧德、泉州、溫州、莆田等地設立分支機構。2009年10月12日，中國銀行業監督管理委員會批準同意福州市商業銀行更名為福建海峽銀行。