我是個小商家可以給題主解答一下！
其實這件事情的原因很簡單，就是賣家沒有和其他快遞合作，而合作的快遞通常也不會多，一般也就一兩家。
合作快遞價格優惠：
通常來說賣家都有自己固定的合作快遞，而長期合作的快遞多少能獲得較為優惠的運費，出貨量越大給的折扣越大，那些大型商家全國通票5元都算貴。現在淘寶上流行的包郵，都是商家拿到的很低的運費折扣在做，你要是讓他換家快遞肯定拿不到好價格，指定快遞發貨就相當于讓賣家虧本，這事誰干？
同時，現在快遞都是使用電子面單，而這個面單部分商家是需要向快遞公司購買的，我既然買了這家快遞的免單，那我肯定優先使用這家快遞了。
最后，這里還涉及到一個服務問題，長期合作的快遞攬收一定是有保障的，在晚也會當天把貨給拉走，雙11時晚上8、9點多快遞小哥還來我這里收件。同時，在售后服務上也相對會更好一些，畢竟對快遞網點來說，你是能為他帶來收益的固定客戶。
非合作快遞價格和攬收都無保障
如果說商家發貨走非合作快遞，也就是買家指定的快遞，那很多東西得不到保障。
首先價格上就是散客價，合作快遞發件全國5元，到這里可能就是10元、14元（下圖就是中通上海發北京的官方指導價，基本就是散客的價格），這就差了好多費用。
其次，如果發貨的量不多，一個兩個的包裹很多快遞員其實是不愿意專門跑來攬收，同樣是跑一趟但沒錢賺啊！當然，對于這種行為賣家可以投訴，但有必要把關系搞這么僵嗎？況且即便投訴了有時候也不管用。
價高服務又沒保障，你說賣家是有多閑給自己沒事找事，去找非合作快遞發件。
Lscssh科技官觀點：
我現在發貨就走中通和申通兩家，如果有買家不樂意要指定快遞發貨，那我只能請他去其他店鋪購買，我不想自己本來就不高的利潤再被運費給剝掉一層。